HMGB2

HMGB2
معرفات
أسماء بديلة	HMGB2, HMG2, high mobility group box 2
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 163906 MGI: MGI:96157 HomoloGene: 37582 GeneCards: 3148
علم الوجود الجيني وظائف جزيئية • ربط دي إن إي • protein domain specific binding • ‏GO:0001131، ‏GO:0001151، ‏GO:0001130، ‏GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • non-sequence-specific DNA binding, bending • single-stranded DNA binding • damaged DNA binding • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني • four-way junction DNA binding • ‏GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RAGE receptor binding • chemoattractant activity • double-stranded DNA binding • DNA binding, bending • supercoiled DNA binding • RNA binding • ‏GO:0001105 transcription coactivator activity مكونات خلوية • سيتوبلازم • بلازم نووي • صبغي • الفراغ خارج الخلية • نوية • perinuclear region of cytoplasm • condensed chromosome • نواة • خارج خلوي • ‏GO:0009327 protein-containing complex عمليات حيوية • DNA geometric change • positive regulation of interferon-beta production • nucleosome assembly • DNA recombination • تفكك الحمض النووي الريبوزي منقوص الأوكسجين التموتي • male gonad development • ‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا • positive regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of erythrocyte differentiation • inflammatory response to antigenic stimulus • immune system process • ‏GO:0044324، ‏GO:0003256، ‏GO:1901213، ‏GO:0046019، ‏GO:0046020، ‏GO:1900094، ‏GO:0061216، ‏GO:0060994، ‏GO:1902064، ‏GO:0003258، ‏GO:0072212 ضبط النسخ انطلاقاً من محفز بوليميراز الرنا الثاني • response to steroid hormone • ‏GO:0031497، ‏GO:0006336، ‏GO:0034724، ‏GO:0001301، ‏GO:0007580، ‏GO:0034652، ‏GO:0010847 chromatin organization • negative regulation of gene expression • نسخ الدنا • ‏GO:0060469، ‏GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • انجذاب كيميائي • response to lipopolysaccharide • ‏GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of nuclease activity • ‏GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • تأشيب جسمي • تكون الحيوانات المنوية • positive regulation of innate immune response • cell chemotaxis • DNA ligation involved in DNA repair • spermatid nucleus differentiation • positive regulation of DNA binding • مناعة فطرية • ‏GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to lipopolysaccharide • inflammatory response • positive regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of neurogenesis • regulation of stem cell proliferation • DNA topological change • ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني • ‏GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • positive chemotaxis • تغيير بنية الكروماتين المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع	الإنسان	الفأر
أنتريه	3148	97165
Ensembl	ENSG00000164104	ENSMUSG00000054717
يونيبروت	P26583	P30681
RefSeq (رنا مرسال.)	‏NM_001130688، ‏NM_001130689 NM_002129، ‏NM_001130688، ‏NM_001130689	‏NM_001363443، ‏NM_001363444، ‏NM_001363445 NM_008252، ‏NM_001363443، ‏NM_001363444، ‏NM_001363445
RefSeq (بروتين)	‏NP_001124161، ‏NP_002120 NP_001124160، ‏NP_001124161، ‏NP_002120	‏NP_001350372، ‏NP_001350373، ‏NP_001350374 NP_032278، ‏NP_001350372، ‏NP_001350373، ‏NP_001350374
الموقع (UCSC	n/a	Chr 8: 57.96 – 57.97 Mb
بحث ببمد	[1]	[2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان اعرض/عدّل فأر

HMGB2‏ (High mobility group box 2) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين HMGB2 في الإنسان.

الوظيفة

يُشفِّر هذا الجين بروتينًا من عائلة بروتينات مجموعة الحركة الكروموسومية غير الهيستونية عالية الحركة. ترتبط بروتينات هذه العائلة بالكروماتين، وتنتشر في كل مكان في نواة الخلايا حقيقية النواة العليا. وقد أظهرت الدراسات المختبرية قدرة هذا البروتين على ثني الحمض النووي (DNA) وتكوين حلقاته بكفاءة. وتشير هذه الدراسات إلى دوره في تسهيل التفاعلات التعاونية بين البروتينات ذات التأثير السيس (cis-acting) من خلال تعزيز مرونة الحمض النووي. كما أُفيد بأن هذا البروتين يشارك في خطوة الربط النهائية في عمليات ربط نهايات الحمض النووي (D(J))، والتي تشمل إصلاح كسور السلسلة المزدوجة للحمض النووي، وإعادة تركيب التأشيب الجسمي.

قراءة متعمقة

• Alexandre S، Li WW، Lee AS (ديسمبر 1992). "A human HMG2 cDNA with a novel 3'-untranslated region". Nucleic Acids Research. ج. 20 ع. 23: 6413. DOI:10.1093/nar/20.23.6413. PMC:334538. PMID:1475204.
• Shirakawa H، Yoshida M (أبريل 1992). "Structure of a gene coding for human HMG2 protein". The Journal of Biological Chemistry. ج. 267 ع. 10: 6641–5. PMID:1551873.
• Bernués J، Espel E، Querol E (مايو 1986). "Identification of the core-histone-binding domains of HMG1 and HMG2". Biochimica et Biophysica Acta. ج. 866 ع. 4: 242–51. DOI:10.1016/0167-4781(86)90049-7. PMID:3697355.
• Zwilling S، König H، Wirth T (مارس 1995). "High mobility group protein 2 functionally interacts with the POU domains of octamer transcription factors". The EMBO Journal. ج. 14 ع. 6: 1198–208. PMC:398197. PMID:7720710.
• Shykind BM، Kim J، Sharp PA (يونيو 1995). "Activation of the TFIID-TFIIA complex with HMG-2". Genes & Development. ج. 9 ع. 11: 1354–65. DOI:10.1101/gad.9.11.1354. PMID:7797075.
• Paull TT، Haykinson MJ، Johnson RC (أغسطس 1993). "The nonspecific DNA-binding and -bending proteins HMG1 and HMG2 promote the assembly of complex nucleoprotein structures". Genes & Development. ج. 7 ع. 8: 1521–34. DOI:10.1101/gad.7.8.1521. PMID:8339930.
• Wanschura S، Schoenmakers EF، Huysmans C، Bartnitzke S، Van de Ven WJ، Bullrdiek J (يناير 1996). "Mapping of the human HMG2 gene to 4q31". Genomics. ج. 31 ع. 2: 264–5. DOI:10.1006/geno.1996.0046. PMID:8824816.
• Nagaki S، Yamamoto M، Yumoto Y، Shirakawa H، Yoshida M، Teraoka H (مايو 1998). "Non-histone chromosomal proteins HMG1 and 2 enhance ligation reaction of DNA double-strand breaks". Biochemical and Biophysical Research Communications. ج. 246 ع. 1: 137–41. DOI:10.1006/bbrc.1998.8589. PMID:9600082.
• Boonyaratanakornkit V، Melvin V، Prendergast P، Altmann M، Ronfani L، Bianchi ME، Taraseviciene L، Nordeen SK، Allegretto EA، Edwards DP (أغسطس 1998). "High-mobility group chromatin proteins 1 and 2 functionally interact with steroid hormone receptors to enhance their DNA binding in vitro and transcriptional activity in mammalian cells". Molecular and Cellular Biology. ج. 18 ع. 8: 4471–87. DOI:10.1128/mcb.18.8.4471. PMC:109033. PMID:9671457.
• Yumoto Y، Shirakawa H، Yoshida M، Suwa A، Watanabe F، Teraoka H (سبتمبر 1998). "High mobility group proteins 1 and 2 can function as DNA-binding regulatory components for DNA-dependent protein kinase in vitro". Journal of Biochemistry. ج. 124 ع. 3: 519–27. DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022143. PMID:9722660.
• Aidinis V، Bonaldi T، Beltrame M، Santagata S، Bianchi ME، Spanopoulou E (أكتوبر 1999). "The RAG1 homeodomain recruits HMG1 and HMG2 to facilitate recombination signal sequence binding and to enhance the intrinsic DNA-bending activity of RAG1-RAG2". Molecular and Cellular Biology. ج. 19 ع. 10: 6532–42. DOI:10.1128/mcb.19.10.6532. PMC:84623. PMID:10490593.
• Butteroni C، De Felici M، Schöler HR، Pesce M (ديسمبر 2000). "Phage display screening reveals an association between germline-specific transcription factor Oct-4 and multiple cellular proteins". Journal of Molecular Biology. ج. 304 ع. 4: 529–40. DOI:10.1006/jmbi.2000.4238. PMID:11099378.
• Stros M، Ozaki T، Bacikova A، Kageyama H، Nakagawara A (مارس 2002). "HMGB1 and HMGB2 cell-specifically down-regulate the p53- and p73-dependent sequence-specific transactivation from the human Bax gene promoter". The Journal of Biological Chemistry. ج. 277 ع. 9: 7157–64. DOI:10.1074/jbc.M110233200. PMID:11748232.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
• Fan Z، Beresford PJ، Zhang D، Lieberman J (أبريل 2002). "HMG2 interacts with the nucleosome assembly protein SET and is a target of the cytotoxic T-lymphocyte protease granzyme A". Molecular and Cellular Biology. ج. 22 ع. 8: 2810–20. DOI:10.1128/MCB.22.8.2810-2820.2002. PMC:133744. PMID:11909973.
• Dubois T، Howell S، Zemlickova E، Aitken A (أبريل 2002). "Identification of casein kinase Ialpha interacting protein partners". FEBS Letters. ج. 517 ع. 1–3: 167–71. DOI:10.1016/S0014-5793(02)02614-5. PMID:12062430.
• Fan Z، Beresford PJ، Zhang D، Xu Z، Novina CD، Yoshida A، Pommier Y، Lieberman J (فبراير 2003). "Cleaving the oxidative repair protein Ape1 enhances cell death mediated by granzyme A". Nature Immunology. ج. 4 ع. 2: 145–53. DOI:10.1038/ni885. PMID:12524539.
• Lv X، Xu DD، Liu DP، Li L، Hao DL، Liang CC (2003). "High-mobility group protein 2 may be involved in the locus control region regulation of the beta-globin gene cluster". Biochemistry and Cell Biology = Biochimie Et Biologie Cellulaire. ج. 80 ع. 6: 765–70. DOI:10.1139/o02-164. PMID:12555809.
• Pallier C، Scaffidi P، Chopineau-Proust S، Agresti A، Nordmann P، Bianchi ME، Marechal V (أغسطس 2003). "Association of chromatin proteins high mobility group box (HMGB) 1 and HMGB2 with mitotic chromosomes". Molecular Biology of the Cell. ج. 14 ع. 8: 3414–26. DOI:10.1091/mbc.E02-09-0581. PMC:181577. PMID:12925773.
• Aird KM، Iwasaki O، Kossenkov AV، Tanizawa H، Fatkhutdinov N، Bitler BG، Le L، Alicea G، Yang TL، Johnson FB، Noma K، Zhang R (أكتوبر 2016). "HMGB2 orchestrates the chromatin landscape of senescence-associated secretory phenotype gene loci". JCB. DOI:10.1083/jcb.201608026. Loss of HMGB2 (High-mobility group protein box 2) during هرم (فيزيولوجيا) blunts SASP (senescence-associated secretory phenotype) جين expression by allowing for spreading of repressive كروماتين مغاير into SASP gene loci. This correlates with incorporation of SASP gene loci into SAHF (senescence-associated heterochromatin foci), which in turn represses SASP gene expression