ATRAID

ATRAID
Ідентифікатори
Символи	ATRAID, APR--3, APR-3, APR3, C2orf28, PRO240, p18, HSPC013, all-trans retinoic acid induced differentiation factor
Зовнішні ІД	MGI: 1918918 HomoloGene: 15412 GeneCards: ATRAID
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • integral component of membrane • lysosomal membrane • клітинна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинне ядро Біологічний процес • регуляція експресії генів • negative regulation of osteoblast proliferation • диференціація клітин • positive regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of bone mineralization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51374	381629
Ensembl	ENSG00000138085	ENSMUSG00000013622
UniProt	Q6UW56	Q6PGD0
RefSeq (мРНК)	NM_080592 NM_001170795 NM_016085	NM_027855 NM_212470
RefSeq (білок)	NP_001164266 NP_057169	NP_082131 NP_997635
Локус (UCSC)	Хр. 2: 27.21 – 27.22 Mb	Хр. 5: 31.21 – 31.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATRAID (англ. All-trans retinoic acid induced differentiation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 229 амінокислот, а молекулярна маса — 24 747.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPHDPGSLT		TLVPWAAALL		LALGVERALA		LPEICTQCPG		SVQNLSKVAF
YCKTTRELML		HARCCLNQKG		TILGLDLQNC		SLEDPGPNFH		QAHTTVIIDL
QANPLKGDLA		NTFRGFTQLQ		TLILPQHVNC		PGGINAWNTI		TSYIDNQICQ
GQKNLCNNTG		DPEMCPENGS		CVPDGPGLLQ		CVCADGFHGY		KCMRQGSFSL
LMFFGILGAT		TLSVSILLWA		TQRRKAKTS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 2