PCDHA4

PCDHA4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WUZ
Ідентифікатори
Символи	PCDHA4, CNR1, CNRN1, CRNR1, PCDH-ALPHA4, protocadherin alpha 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606310 MGI: 1298406 HomoloGene: 130626 GeneCards: PCDHA4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • синапс Біологічний процес • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56144	12936
Ensembl	ENSG00000204967	ENSMUSG00000104252
UniProt	Q9UN74	O88689
RefSeq (мРНК)	NM_031500 NM_018907	NM_007766
RefSeq (білок)	NP_061730 NP_113688	NP_001167625
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.81 – 141.01 Mb	Хр. 18: 37.09 – 37.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHA4 (англ. Protocadherin alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 947 амінокислот, а молекулярна маса — 102 293.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEFSWGSGQE		SRRLLLLLLL		LAAWEAGNGQ		LHYSVSEEAK		HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV		PRLFRVASKG		RGGLLEVNLQ		NGILFVNSRI		DREELCRRSA
ECSIHLEVIV		DRPLQVFHVD		VEVRDINDNP		PVFPATQKNL		SIAESRPLDS
RFPLEGASDA		DIGENALLTY		RLSPNEYFSL		EKPPDDELVK		GLGLILRKSL
DREEAPEIFL		VLTATDGGKP		ELTGTVQLLI		TVLDANDNAP		AFDRTIYKVR
LLENVPNGTL		VIKLNASDLD		EGLNGDIVYS		FSNDISPNVK		SKFHIDPITG
QIIVKGYIDF		EESKSYEIIV		EGIDKGQLPL		SGHCRVIVEV		EDNNDNVPDL
EFKSLSLPIR		EDAPLGTVIA		LISVSDKDMG		VNGLVTCSLT		SHVPFKLVST
FKNYYSLVLD		SALDRESVSA		YELVVTARDG		GSPSLWATAS		VSVEVADVND
NAPAFAQPEY		TVFVKENNPP		GCHIFTVSAW		DADAQENALV		SYSLVERRVG
ERALSSYVSV		HAESGKVYAL		QPLDHEELEL		LQFQVTARDA		GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND		NAPALLAPRA		GGTGGAVSEL		VPWSVGVGHV		VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE		LQPGTGGARI		PFRVGLYTGE		ISTTRALDET		DAPRHRLLVL
VKDHGEPALT		ATATVLVSLV		ESGQAPKASS		RALVGAVGPD		AALVDVNVYL
IIAICAVSSL		LVLTLLLYTA		LRCSALPTEG		ACAPGKPTLV		CSSAVGSWSY
SQQRRPRVCS		GEGPPKTDLM		AFSPSLPDSR		DREDQLQTTE		ESFAKPRQPN
PDWRYSASLR		AGMHSSVHLE		EAGILRAGPG		GPDQQWPTVS		SATPEPEAGE
VSPPVGAGVN		SNSWTFKYGP		GNPKQSGPGE		LPDKFIIPGS		PAIISIRQEP
TNSQIDKSDF		ITFGKKEETK		KKKKKKKGNK		TQEKKEKGNS		TTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 doi:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5