SVIL

SVIL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2K6M, 2K6N
Ідентифікатори
Символи	SVIL, supervillin, MFM10
Зовнішні ІД	OMIM: 604126 MGI: 2147319 HomoloGene: 25090 GeneCards: SVIL
Онтологія гена Молекулярна функція • actin filament binding • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • microtubule minus-end • podosome • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • cell projection • midbody • Борозна розщеплення • costamere • цитоскелет • мембрана • клітинне ядро • focal adhesion • actin cytoskeleton • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of cytokinesis • skeletal muscle tissue development • cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6840	225115
Ensembl	ENSG00000197321	ENSMUSG00000024236
UniProt	O95425	Q8K4L3
RefSeq (мРНК)	NM_003174 NM_021738 NM_001323599 NM_001323600	NM_153153 NM_178046 NM_001347449
RefSeq (білок)	NP_001310528 NP_001310529 NP_003165 NP_068506	NP_001334378 NP_694793 NP_001392206 NP_001392207 NP_001392209 NP_001392210 NP_001392211 NP_001392219
Локус (UCSC)	Хр. 10: 29.46 – 29.74 Mb	Хр. 18: 4.92 – 5.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SVIL (англ. Supervillin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 214 амінокислот, а молекулярна маса — 247 746.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRKERIARR		LEGIENDTQP		ILLQSCTGLV		THRLLEEDTP		RYMRASDPAS
PHIGRSNEEE		ETSDSSLEKQ		TRSKYCTETS		GVHGDSPYGS		GTMDTHSLES
KAERIARYKA		ERRRQLAEKY		GLTLDPEADS		EYLSRYTKSR		KEPDAVEKRG
GKSDKQEESS		RDASSLYPGT		ETMGLRTCAG		ESKDYALHVG		DGSSDPEVLL
NIENQRRGQE		LSATRQAHDL		SPAAESSSTF		SFSGRDSSFT		EVPRSPKHAH
SSSLQQAASR		SPSFGDPQLS		PEARPSTGKP		KHEWFLQKDS		EGDTPSLINW
PSRVKVREKL		VKEESARNSP		ELASESVTQR		RHQPAPVHYV		SFQSEHSAFD
RVPSKAAGST		RQPIRGYVQP		ADTGHTAKLV		TPETPENASE		CSWVASATQN
VPKPPSLTVL		EGDGRDSPVL		HVCESKAEEE		EGEGEGEEKE		EDVCFTEALE
QSKKTLLALE		GDGLVRSPED		PSRNEDFGKP		AVSTVTLEHQ		KELENVAQPP
QAPHQPTERT		GRSEMVLYIQ		SEPVSQDAKP		TGHNREASKK		RKVRTRSLSD
FTGPPQLQAL		KYKDPASRRE		LELPSSKTEG		PYGEISMLDT		KVSVAQLRSA
FLASANACRR		PELKSRVERS		AEGPGLPTGV		ERERGSRKPR		RYFSPGESRK
TSERFRTQPI		TSAERKESDR		CTSHSETPTV		DDEEKVDERA		KLSVAAKRLL
FREMEKSFDE		QNVPKRRSRN		TAVEQRLRRL		QDRSLTQPIT		TEEVVIAATE
PIPASCSGGT		HPVMARLPSP		TVARSAVQPA		RLQASAHQKA		LAKDQTNEGK
ELAEQGEPDS		STLSLAEKLA		LFNKLSQPVS		KAISTRNRID		TRQRRMNARY
QTQPVTLGEV		EQVQSGKLIP		FSPAVNTSVS		TVASTVAPMY		AGDLRTKPPL
DHNASATDYK		FSSSIENSDS		PVRSILKSQA		WQPLVEGSEN		KGMLREYGET
ESKRALTGRD		SGMEKYGSFE		EAEASYPILN		RAREGDSHKE		SKYAVPRRGS
LERANPPITH		LGDEPKEFSM		AKMNAQGNLD		LRDRLPFEEK		VEVENVMKRK
FSLRAAEFGE		PTSEQTGTAA		GKTIAQTTAP		VSWKPQDSSE		QPQEKLCKNP
CAMFAAGEIK		TPTGEGLLDS		PSKTMSIKER		LALLKKSGEE		DWRNRLSRRQ
EGGKAPASSL		HTQEAGRSLI		KKRVTESRES		QMTIEERKQL		ITVREEAWKT
RGRGAANDST		QFTVAGRMVK		KGLASPTAIT		PVASPICGKT		RGTTPVSKPL
EDIEARPDMQ		LESDLKLDRL		ETFLRRLNNK		VGGMHETVLT		VTGKSVKEVM
KPDDDETFAK		FYRSVDYNMP		RSPVEMDEDF		DVIFDPYAPK		LTSSVAEHKR
AVRPKRRVQA		SKNPLKMLAA		REDLLQEYTE		QRLNVAFMES		KRMKVEKMSS
NSNFSEVTLA		GLASKENFSN		VSLRSVNLTE		QNSNNSAVPY		KRLMLLQIKG
RRHVQTRLVE		PRASALNSGD		CFLLLSPHCC		FLWVGEFANV		IEKAKASELA
TLIQTKRELG		CRATYIQTIE		EGINTHTHAA		KDFWKLLGGQ		TSYQSAGDPK
EDELYEAAII		ETNCIYRLMD		DKLVPDDDYW		GKIPKCSLLQ		PKEVLVFDFG
SEVYVWHGKE		VTLAQRKIAF		QLAKHLWNGT		FDYENCDINP		LDPGECNPLI
PRKGQGRPDW		AIFGRLTEHN		ETILFKEKFL		DWTELKRSNE		KNPGELAQHK
EDPRTDVKAY		DVTRMVSMPQ		TTAGTILDGV		NVGRGYGLVE		GHDRRQFEIT
SVSVDVWHIL		EFDYSRLPKQ		SIGQFHEGDA		YVVKWKFMVS		TAVGSRQKGE
HSVRAAGKEK		CVYFFWQGRH		STVSEKGTSA		LMTVELDEER		GAQVQVLQGK
EPPCFLQCFQ		GGMVVHSGRR		EEEEENVQSE		WRLYCVRGEV		PVEGNLLEVA
CHCSSLRSRT		SMVVLNVNKA		LIYLWHGCKA		QAHTKEVGRT		AANKIKEQCP
LEAGLHSSSK		VTIHECDEGS		EPLGFWDALG		RRDRKAYDCM		LQDPGSFNFA
PRLFILSSSS		GDFAATEFVY		PARAPSVVSS		MPFLQEDLYS		APQPALFLVD
NHHEVYLWQG		WWPIENKITG		SARIRWASDR		KSAMETVLQY		CKGKNLKKPA
PKSYLIHAGL		EPLTFTNMFP		SWEHREDIAE		ITEMDTEVSN		QITLVEDVLA
KLCKTIYPLA		DLLARPLPEG		VDPLKLEIYL		TDEDFEFALD		MTRDEYNALP
AWKQVNLKKA		KGLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• Fang Z., Luna E.J. (2013). Supervillin-mediated suppression of p53 protein enhances cell survival. J. Biol. Chem. 288: 7918—7929. PMID 23382381 doi:10.1074/jbc.M112.416842
• Crowley J.L., Smith T.C., Fang Z., Takizawa N., Luna E.J. (2009). Supervillin reorganizes the actin cytoskeleton and increases invadopodial efficiency. Mol. Biol. Cell. 20: 948—962. PMID 19109420 doi:10.1091/mbc.E08-08-0867
• Brown J.W., Vardar-Ulu D., McKnight C.J. (2009). How to arm a supervillin: designing F-actin binding activity into supervillin headpiece. J. Mol. Biol. 393: 608—618. PMID 19683541 doi:10.1016/j.jmb.2009.08.018

Див. також

• Хромосома 10